Das zentrale Verwaltungsprojekt Z koordiniert alle administrativen Prozesse, den wissenschaftlichen Austausch, die strategische Beratung, das Berichtswesen sowie die Finanzen des SFB. Es organisiert unter anderem Konferenzen, Retreats, Mitgliederversammlungen, Gastaufenthalte, Strategietreffen und Sommerschulen. 

Zudem werden übergreifende Dienstleistungen im IT-Bereich durch den Softwareentwickler bereitgestellt.